中山大學藥學院是原中山大學和中山醫科大學兩校合并后于2002年6月成立的第一個學院。學院以中山大學生命科學學院藥學系為基礎，整合了化學與化學工程學院以及中山醫學院相關藥學資源，以中山大學的綜合力量為依托組建而成。

　　學院成立后，在學校的大力支持下，狠抓學科建設，積極引進各類人才，加強各種硬件建設，不斷完善各項規章制度，倡導“嚴謹、求實、活力、創新、凝心、和諧”的學院文化核心理念，充分調動教職員工積極性，努力營造學院文化。

　　學院坐落在中山大學廣州校區東校園（廣州大學城）。學院設有藥物化學與藥物分子設計實驗室、藥劑學與制藥工程實驗室、藥物代謝與藥動學實驗室、藥理與毒理學實驗室、生藥學與天然藥化實驗室、微生物與生化制藥實驗室、藥物分析與質量評價實驗室、結構生物學實驗室等8個實驗室。學院實行課題負責人制度，成立了陳新滋院士研究團隊等12個PI團隊。

　　學科實力

　　2017年中山大學入選36所A類一流大學建設高校之一，學校共11個學科入選“雙一流”建設學科名單，藥學學科名列其中。2017年，中山大學藥學學科在教育部公布的第四輪學科評估中獲A-，較第三輪學科評估排名顯著提升。2018年3月，ESI“藥理學和毒理學”排名全球132位（前0.5%），國內第8位；2018年1月，QS“藥學與藥理學”（Pharmacy&Pharmacology）排名全球151-200位，國內第7位；2018年1月，USnews“藥理學與毒理學”（Pharmacology&Toxicology）排名全球第57位，國內第6位；2017年6月，ARWU“藥學與制藥科學”（pharmacy&PharmaceuticalSciences）排名全球76-100位，國內第5位。